震后唐家河自然保护区大熊猫种群的遗传结构

科技成果来源：四川科技成果库;
地区：四川
成果名称：震后唐家河自然保护区大熊猫种群的遗传结构
成果类型：基础研究
技术领域：自然科学研究与试验发展
成果完成单位：成都大熊猫繁育研究基地;
成果完成人：侯蓉;张志和;沈富军;杨建东;张亮;张文平;
成果简介：
任务来源：该项目得到国家973计划前期研究专项基金以及成都大熊猫繁育研究基金共同资助。应用领域和技术原理：该研究属濒危野生动物保护生物学领域，应用于大熊猫的科学保护与管理。采用非损伤性取样方法采集野生大熊猫粪便和毛发样品，结合分子生物学技术相关原理提取粪便和毛发dNa，PcR扩增位于编码牙轴蛋（aMEl）第五外显子上的一段同源片段aMElX/aMElY进行性别鉴定，采用微卫星标记结合多管法进行基因分型，利用EXcEl中的MStOOlS插件寻找数据中相匹配的基因型并进行个体识别，使用cERVUS3.0、GENEPOP3.4、FStat2.9.3及StRUctURE等软件分析处理基因型数据，进而对种群的等位基因多样性、杂合度、多态信息含量等参数进行估计。与国内外同类技术比较：用于大熊猫亲子鉴定的微卫星标记主要有：张亚平等（1996）开发的8个GP系列引物；lüZHI等（2001）开发的18个aME系列引物；沈富军等（2005）20个cd系列引物。但是，上述微卫星标记没有经过系统的群体遗传学检测和评估，质量参差不齐：许多微卫星标记具有较高的突变率，还容易出现多重扩增、假扩增、零扩增等现象，给基因分型带来种种困难。该研究是在长期对圈养大熊猫亲子鉴定和谱系分析工作基础上，建立了个体数达110只的大熊猫微卫星数据库，对dyNal磁珠富集大熊猫微卫星标记的数据进行标准化，最后获得了11个具有高度稳定性的微卫星标记用于震后大熊猫的调查。在基因分型和个体识别技术上，以往都使用传统的ROX-350或ROX-500来做基因分型，由于这些标准物尺度较大，不同批次、不同系统（如仪器差异、人员更换）的分型产物都非常容易出现系统误差。本率先用PcR产物克隆制备出11个基因座的等位基因分型标准物用于野外大熊猫基因型分型，个体识别及数量调查。该研究进一步提高了野外大熊猫样品基因分型的准确性，实现了野生大熊猫个体识别、遗传结构分析。该次研究初步建立了完善的野外大熊猫种群数量、分布调查的技术流程，为今后的持续的大熊猫生态监测提供技术支持。成果的创造性、先进性：该项研究使用最新研制的大熊猫亲子鉴定试剂盒，有效地对野生大熊猫dNa样品进行基因型分型，个体识别。"5.12"汶川地震后唐家河保护区有42只大熊猫，唐家河保护区大熊猫数量较前有所增加，地震并未造成唐家河大熊猫种群数量变化。唐家河保护区大熊猫并未发生遗传分化，洪石河和摩天岭两个区域的大熊猫样本都聚为一个种群，震并未造成唐家河大熊猫种群遗传结构的改变。率先报道震后大熊猫个体数量、分布及遗传结构状况。成果完成人：侯蓉;张志和;沈富军;杨建东;张亮;张文平;
成果登记/公布年份：2014年
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